《仙剑奇侠传三外传·问情篇》的剧情如下：
1. 故事背景：
- 由于未知原因，蜀山仙境开始崩坏，地脉门户大开。前往探查的蜀山长老及弟子，被地脉中抵克蜀山仙术的瘴气化去功力，苦战不敌妖众，悉数殒命。掌门徐长卿临危授命，责令自小长在蜀山却一直未被收入门下的少年——南宫煌，携带书信前往绿萝山，求助于掌握蜀山秘宝五灵轮的清冷仙人。
2. 主角团的相遇与组队：
- 南宫煌：狼妖与人之混血，赤炎与丝缎之子，星璇之弟。他从小在蜀山长大，爱现，喜欢招摇撞骗，略通占卜、占星之术。他接受徐长卿的命令，踏上了寻找清冷仙人的旅程，也由此开启了一系列奇妙的冒险。
- 温慧：尚武的郡王千金，最大的爱好是舞刀弄剑，对马弓之术、阵战之法、军器之用、行伍之律颇有心得，擅长铸造刀剑武器。她天生怪力，爽朗大方，性情如同男子，极富正义感。温慧为了逃婚来到蜀山，和南宫煌相遇，并一同踏上旅程。
- 王蓬絮：传说中的五毒兽，可孕育五毒珠。她如山中精灵般纤细，掌握读心术，善于交际应酬，但敏感而神经质。她在与南宫煌等人的相处过程中逐渐加入队伍。
- 星璇：具上位者的气质，有领导才能，在妖界有一定势力。他的身体其实是一具尸体（其父亲周赤炎的），初时灵肉分离，身体毫无感觉，后经重楼相助灵肉合一。为使尸身不坏，使用剧毒保存，故无法进入人界，绝大多数时间身在里蜀山。他是南宫煌的哥哥，与南宫煌等人相识后，共同面对诸多挑战。
- 雷元戈：鬼界召魂之使，曾受命召徐长卿之魂，因长卿成仙而无法完成任务，遂流浪于人界，逃避罪责。他口不能言，会腹语，有时日常说话会唤出三只小型召唤兽（风、雅、颂）代劳。在机缘巧合下与南宫煌等人结识，并加入队伍。
3. 主要剧情事件：
- 月光城之旅：众人来到苗疆小镇施洞的女娲神庙，遇到少女离宫。离宫痴恋汉人侠客陆北亭，而陆北亭每年正月十五都会进入月光城寻找失踪的未婚妻月纬。此时恰逢月光城出现，但陆北亭却未按时出现，众人答应帮离宫寻找陆北亭。在月光城，他们发现了陆北亭和月纬，以及自称月光城主人的风灵兽。原来三年前陆北亭和月纬遇妖兽，陆临阵逃脱，月纬被风灵兽所救并成为其妻子，现已有身孕。陆北亭攻击风灵兽，众人与风灵兽发生战斗。战胜后，陆北亭死去，离宫自杀，月纬斥责众人多管闲事，风灵兽带着月纬离开。
- 里蜀山的秘密：主角团在里蜀山不断探索，发现了里蜀山妖界的内部矛盾和权力斗争。里蜀山妖界的支配者燎日，对里蜀山内城施行集权统治，并且似乎在谋划着什么阴谋。他们逐渐了解到星璇与燎日之间的关系，以及多年前的一些秘密。
- 火魔兽的危机：燎日意图以温慧或王蓬絮作祭品唤醒火魔兽，给人间带来灾难。主角团为了阻止燎日的阴谋，与他展开了一场激烈的战斗。
4. 结局：
- 温慧结局：王蓬絮的好感度高于温慧，南宫煌去花圃找王蓬絮聊天时，王蓬絮用五毒珠帮南宫煌解毒。最后王蓬絮变成五毒兽独自离去，雷元戈加入队伍。决战之后雷元戈、星璇相继牺牲，燎日意图以温慧作祭品唤醒火魔兽。温慧意识到自己的责任决定直面和亲，南宫煌找到为救自己回复原型的王蓬絮后，到室韦履行对温慧的承诺，成为室韦的国师。
- 王蓬絮结局：温慧的好感度高于王蓬絮，摄灵法阵使用不足360次。最后王蓬絮加入队伍，雷元戈独自离去。思堂、星璇相继牺牲，后南宫煌帮星璇还魂，王蓬絮终于明白自己心中所恋，为星璇长跪守墓。
- 隐藏结局（完美结局）：温慧的好感度高于王蓬絮，摄灵法阵使用360次以上。最后王蓬絮加入队伍，雷元戈独自离去。思堂为救星璇而牺牲，五灵轮突然发威，战胜燎日，南宫煌按照养父常纪的意思带着家人隐居石村，王蓬絮也终于和星璇走到了一起。。
